общее сходство по форме, размеру, ультраструктуре мембран митохондрий и бактерий, специфическими ферментными комплексами, хлоропластов и синезелёных водорослей;
кольцевая молекула ДНК;
образование путем бинарного деления независимо от клетки;
сходство на биохимическом уровне;
наличие собственного белкового синтеза;
мелкие рибосомы прокариотического типа;
движение митохондрий напоминает движение некоторых бактерий;
ферменты белкового синтеза у митохондрий, хлоропластов и бактерий, с одной стороны, и в цитоплазме — с другой, чувствительны к разным антибиотикам;
двуслойная мембрана: внутренний слой сходен по составу с бактериальными клетками, а внешний — с мембранами пищеварительных вакуолей эукариот.